萨摩耶的被毛飘逸而灵动。但是，如果对动物的皮毛过敏，最好到专业的医院做一个过敏源的测试;如果有哮喘等疾病的家人，也要先进行诊断，并采取有针对性的措施，不要过多地和萨摩耶接触, 尤其要在家中适量地加大湿度，防止家中漂浮着过多的飞毛。
所以，养宠家庭环境的卫生也关系到家庭中每一个成员的身体健康，尤其是有老人和小孩的家中，更要注重卫生、清洁、除味。
萨摩耶每日都要外出遛弯，难免携带一些细菌或病毒;几天下来，白色的被毛就会脏脏的，不仅有灰尘，还会挂上一些“小零碎”;外出郊游，会粘上草丛中尖锐的“小果食”，还有可能遇到体外的寄生虫……这样，每日回家前最好先对萨摩进行“卫生”清理，避免家居环境的二次“污染”。
随着萨摩耶的成长，个头越来越大，建议给予它一定的区域限制，尤其是卧室、厨房、沙发以及有地毯的地方，一方面避免让萨摩多接触，另一方面，要定期做好彻底清洁。
萨摩耶自身的体味并不是很大，但或多或少也会让家中存在“狗狗”的气息。例如，狗狗的皮毛护理不当、细小的飞毛、长期不清理笼具和窝具、木质宠物房屋受潮和霉虫滋生、外出刮蹭带至家中的异物、自身口腔、耳道、肛门腺体等都会令家中飘散着狗狗的特殊味道。
有效的措施是定期给萨摩耶洗澡、进行整体清洁、皮毛梳理，经常对笼具和窝具进行消毒、清洁和除味，同时更要有效地护理和清洁其口腔，耳道、肛门腺体等部位。
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